CG Comparative Genome Analysis

비교유전체분석

Overview

비교 유전체 분석(Comparative genome analysis, CG)은 서로 다른 생물 간의 유전체를 염기서열 수준에서 비교하고 분석하고자 발전된 연구 분야입니다. NGS의 발전에 힘입어 염기서열 분석에 드는 시간과 비용이 대단히 절감되면서, 미생물을 연구하는 전세계의 학자들은 빠르게 다양한 균주들의 유전체를 완성하게 되었습니다. 단일 균주의 유전체 연구가 활발히 진행되면서 학계에서는 자연스럽게 타 균주와의 비교를 통해 전에 알지 못했던 유전자의 기능과 진화적 특성 등을 살펴보려는 시도가 이루어지게 되었습니다. 현재는 NCBI, EzBioCloud 등을 통한 다양한 데이터베이스에서 이러한 유전체 정보를 손쉽게 구할 수 있어, 이전에는 어려웠던 전장 유전체(whole genome) 간의 비교 분석을 진행할 수 있게 되었습니다.

천랩은 점차로 증가하고 있는 비교유전체 연구의 필요성에 주목하였으며, 엄선된 미생물 유전체 데이터베이스를 이용한 비교유전체 분석 서비스를 개발하였습니다. 비교유전체 분석을 통해 연구자들은 병원균과 비병원균 간의 유전체 차이를 분석하여 병원성을 부여하는 유전자를 탐색할 수 있으며, 유전체 계통을 파악하여 병원균의 역학조사에도 적극 활용할 수 있습니다. 균주들의 유전자 합집합인 pan-genome, 교집합인 core-genome을 분석하여 진화의 방향 및 불명확한 유전자 기능을 유추하고, 항생제 내성 분석, 진단용 biomarker 찾기, 이차 대사 연구 등 각종 응용분야에 다양하게 적용 할 수 있습니다. 클라우드 시스템에 기반한 천랩의 비교유전체 분석(CG) 서비스는 연구를 위해 필수적인 데이터와 직관적인 시각자료를 제공하며, 비교유전체 연구에 익숙하지 않은 사용자도 어렵지 않게 분석 결과를 해석하고 활용할 수 있도록 인터페이스를 갖추었습니다.

Comparative Genome Analysis

천랩의 비교유전체 분석(CG) 서비스는 검증된 44,000개 이상의 최신 미생물 유전체 데이터 베이스를 기반으로 하고 있습니다. 균주 유전체와 데이터베이스의 유전체를 자유롭게 선택하여 한번에 비교 분석이 가능합니다.
학술적으로 인정된 최상의 데이터베이스
  • 정기적인 업데이트를 통한 최신 정보 확보
  • 모든 염기서열에 대한 종 수준까지의 동정
자체 개발한 웹 분석 플랫폼
  • 클라우드 기반의 웹 브라우저
  • 모든 분석 결과에 대한 이미지화 및 세부 데이터 다운로드
  • 연구자간의 데이터 공유 및 빅 테이터 관리 기능
  • EzBioCloud genome DB와 유전체 비교 분석
최고의 기술력과 차별화된 컨설팅 서비스
  • 풍부한 경험으로 숙련된 NGS 전문가 인력 구성
  • 석박사급의 직원들이 직접 연구 자문 지원
최적의 분석 파이프라인
  • OrthoANI, tetra-nucleotide를 이용한
    유전체 기반 계통분석
  • 유전체간의 상동유전자를 찾아내는 matrix 생성
  • Pan/core genome 을 이용한 통합적 유전체 분석
  • 핵심적인 유전자와 대사 경로 탐색

Data visualization & Biomarker discovery

CG 웹 분석 플랫폼은 언제 어디서든 인터넷만 연결되어 있다면 웹 브라우저를 통해 바로 결과를 보여줍니다. 유전체들을 일대일(pairwise)로 비교하여 유전자 레벨의 유사도를 계산하고 한눈에 보여주는 matrix를 제공합니다. 비교되는 유전체들의 정보를 하나로 통합하여 어떤 유전자들을 공통적으로 보유하는지, 어떤 유전자를 독자적으로 가지고 있는지를 비교 분석할 수 있습니다. 비 병원균 그룹과 병원균 그룹을 비교 분석할 경우 통계적 차이를 통해 병원균에서만의 특이적 유전자 탐색이 가능합니다. 대사 경로 분석을 위해 KEGG pathway와 연동된 시스템을 이용하여 대사 경로를 탐색 할 수 있습니다.
GRIIS
프로바이오틱스 성분검사
및 균주동정
프로바이오틱스 제품에 사용하는 균주의 정확한 동정 및 제품내 혼합된 균주 성분 검사 서비스
MTP
미생물군집분석
NGS를 이용한 16S rRNA의 염기서열 분석을 통한 미생물 군집 분석 서비스
WG
전장유전체분석
NGS를 이용한 미생물 전장 유전체 염기서열 해독 및 생명 정보 분석 서비스
RS
전사체분석
NGS를 이용한 전사체 염기서열 해독 및 세부 유전자 발현 정보 분석 서비스
CG
비교유전체분석
전장 유전체를 비교하여 통계적 차이에 의한 통계학적 생물 지표 발견 및 특이적 유전자 탐색 서비스
16S ID
16S 동정 및 데이터베이스
16S rRNA 염기서열 기반의 미생물 분류 및 동정 데이터베이스 제공 서비스