RS RNA Sequencing

전사체분석

Overview

모든 생명체는 자신의 유전 정보를 발현시키기 위해서 유전자 DNA 서열을 mRNA라고 하는 중간 매개체로 전사(transcription)하는 과정을 필수적으로 거치게 됩니다. 이러한 mRNA를 분석한다면 특정 시점에서 대상 생명체에 활성화된 유전자 정보를 파악할 수 있습니다. 기존에는 microarray와 같은 전통적인 방법을 이용하여 유전자 발현 분석 연구가 진행되었으나, NGS의 획기적인 발전에 따라 전사체(transcriptome) 분석의 품질, 속도, 비용 측면에서 microarray의 분석 한계를 넘어 매우 효율적으로 연구에 적용 할 수 있게 되었습니다. 특히 바이오메디컬 분야에 있어서 항생제에 대한 저항성 연구, 숙주와 병원균 간의 면역 반응, 질병 단계의 추적 등 다양한 방면으로 유용하게 활용될 수 있습니다. 천랩은 생명체에 존재하는 RNA의 집합인 전사체의 염기서열 정보를 밝히고, 고유의 데이터베이스와 고도화된 생명정보 분석 방법을 통해 최적의 솔루션을 제시합니다.

Transcriptome Analysis

천랩의 RNA sequencing은 NGS 실험부터 생명정보분석에 이르기까지 원스톱 솔루션을 제공하는 서비스입니다. 자체 구축한 데이터베이스를 기반으로 분석된 결과를 RNASeq 전용 분석 소프트웨어와 함께 제공합니다. 소프트웨어는 시료의 비교 분석을 위해 반드시 필요한 2차 분석 기능(DEG분석, Clustering 분석, eggNOG functional category 분석, KEGG pathway 분석, Gene Ontology 분석 등)을 포함합니다. 이를 통해 연구자들은 간편하게 분석결과를 해석하고, 스스로 손쉽게 추가 맞춤형 분석을 수행할 수 있습니다.
천랩 고유의 데이터베이스 및 최적화된 파이프라인
  • 공개된 생물 유전체 정보의 큐레이션한 데이터베이스
  • 다양한 종류의 샘플 및 NGS 플랫폼에 적용 가능한 파이프라인
자체 개발한 2차 분석 전용 CLRNASeq™ 소프트웨어
  • 다양한 통계 값 제공 및 분석 결과의 시각화
  • 서로 다른 샘플의 유전자 발현 양상 비교
  • 유사한 유전자 발현 양상을 나타내는 유전자 그룹 탐색
  • Pathway 분석 지원
최고의 기술력과 차별화된 컨설팅 서비스
  • 풍부한 경험으로 숙련된 NGS 전문가 인력 구성
  • 석박사급의 직원들이 직접 연구 자문 지원
최신 NGS 장비들을 통한 서비스라인
Illumina NGS system

https://www.illumina.com

PacBio NGS system

http://www.pacb.com

Bioinformatics pipeline

천랩의 분석은 다양한 종 및 플랫폼에 최적화된 파이프라인을 사용합니다.

Data visualization & Biomarker discovery

CLRNASeq™ 분석소프트웨어는 독자 기술로 구축한 전사체 발현 분석결과의 2차 분석을 위한 소프트웨어입니다. RNA-Seq 파이프라인의 수행 결과로 대용량의 염기서열 데이터로부터 각 유전자의 발현량, 발현 양상 및 기타 다양한 통계값이 확장자가 clt인 데이터 파일로 제공되며, 결과를 전용 데이터 브라우저를 통해 시각화하여 확인할 수 있습니다.
GRIIS
프로바이오틱스 성분검사
및 균주동정
프로바이오틱스 제품에 사용하는 균주의 정확한 동정 및 제품내 혼합된 균주 성분 검사 서비스
MTP
미생물군집분석
NGS를 이용한 16S rRNA의 염기서열 분석을 통한 미생물 군집 분석 서비스
WG
전장유전체분석
NGS를 이용한 미생물 전장 유전체 염기서열 해독 및 생명 정보 분석 서비스
RS
전사체분석
NGS를 이용한 전사체 염기서열 해독 및 세부 유전자 발현 정보 분석 서비스
CG
비교유전체분석
전장 유전체를 비교하여 통계적 차이에 의한 통계학적 생물 지표 발견 및 특이적 유전자 탐색 서비스
16S ID
16S 동정 및 데이터베이스
16S rRNA 염기서열 기반의 미생물 분류 및 동정 데이터베이스 제공 서비스